Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Calr3Q9D9Q6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calr3Q9D9Q6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calr3Q9D9Q6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Calr3Q9D9Q6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calr3Q9D9Q6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calr3Q9D9Q6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calr3Q9D9Q6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calr3Q9D9Q6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calr3Q9D9Q6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calr3Q9D9Q6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calr3Q9D9Q6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calr3Q9D9Q6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calr3Q9D9Q6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calr3Q9D9Q6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calr3Q9D9Q6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calr3Q9D9Q6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calr3Q9D9Q6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calr3Q9D9Q6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calr3Q9D9Q6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calr3Q9D9Q6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calr3Q9D9Q6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calr3Q9D9Q6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Calr3Q9D9Q6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Calr3Q9D9Q6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calr3Q9D9Q6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms