Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P2

Ccdc103, Coiled-coil domain-containing protein 103, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc103Q9D9P2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc103Q9D9P2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc103Q9D9P2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc103Q9D9P2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc103Q9D9P2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms