Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifrd2Q9D8U0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifrd2Q9D8U0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms