Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fip1l1Q9D824 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fip1l1Q9D824 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms