Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M8

Polr2d, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2dQ9D7M8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr2dQ9D7M8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Polr2dQ9D7M8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr2dQ9D7M8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms