Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbe1Q9D6Y9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbe1Q9D6Y9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms