Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc81Q9D5W4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc81Q9D5W4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc81Q9D5W4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc81Q9D5W4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc81Q9D5W4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc81Q9D5W4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc81Q9D5W4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc81Q9D5W4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc81Q9D5W4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc81Q9D5W4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc81Q9D5W4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc81Q9D5W4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc81Q9D5W4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc81Q9D5W4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc81Q9D5W4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc81Q9D5W4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc81Q9D5W4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc81Q9D5W4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc81Q9D5W4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc81Q9D5W4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc81Q9D5W4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc81Q9D5W4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc81Q9D5W4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc81Q9D5W4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms