Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V6

Syap1, Synapse-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syap1Q9D5V6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syap1Q9D5V6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syap1Q9D5V6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syap1Q9D5V6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms