Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrp2bpQ9D4C6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrp2bpQ9D4C6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms