Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V8

Fam227a, Family with sequence similarity 227, member A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227aQ9D3V8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam227aQ9D3V8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fam227aQ9D3V8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam227aQ9D3V8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam227aQ9D3V8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam227aQ9D3V8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam227aQ9D3V8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam227aQ9D3V8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam227aQ9D3V8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam227aQ9D3V8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam227aQ9D3V8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam227aQ9D3V8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam227aQ9D3V8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam227aQ9D3V8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam227aQ9D3V8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam227aQ9D3V8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam227aQ9D3V8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam227aQ9D3V8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam227aQ9D3V8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam227aQ9D3V8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam227aQ9D3V8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam227aQ9D3V8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam227aQ9D3V8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms