Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Katnal2Q9D3R6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Katnal2Q9D3R6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Katnal2Q9D3R6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms