Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3P2

5330417H12Rik, MCG147567, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5330417H12RikQ9D3P2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
5330417H12RikQ9D3P2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.32■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.28■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.27■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.27■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
5330417H12RikQ9D3P2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
5330417H12RikQ9D3P2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms