Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pramef12Q9D2F1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pramef12Q9D2F1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pramef12Q9D2F1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pramef12Q9D2F1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms