Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Batf3Q9D275 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Batf3Q9D275 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Batf3Q9D275 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Batf3Q9D275 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Batf3Q9D275 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Batf3Q9D275 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Batf3Q9D275 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Batf3Q9D275 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Batf3Q9D275 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Batf3Q9D275 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Batf3Q9D275 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Batf3Q9D275 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Batf3Q9D275 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Batf3Q9D275 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Batf3Q9D275 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Batf3Q9D275 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Batf3Q9D275 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Batf3Q9D275 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Batf3Q9D275 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Batf3Q9D275 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Batf3Q9D275 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Batf3Q9D275 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Batf3Q9D275 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Batf3Q9D275 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Batf3Q9D275 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Batf3Q9D275 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Batf3Q9D275 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Batf3Q9D275 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Batf3Q9D275 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms