Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Z3

Fam173b, Protein FAM173B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam173bQ9D1Z3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam173bQ9D1Z3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam173bQ9D1Z3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam173bQ9D1Z3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms