Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nol3Q9D1X0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nol3Q9D1X0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nol3Q9D1X0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nol3Q9D1X0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nol3Q9D1X0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nol3Q9D1X0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nol3Q9D1X0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nol3Q9D1X0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nol3Q9D1X0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nol3Q9D1X0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nol3Q9D1X0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nol3Q9D1X0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nol3Q9D1X0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nol3Q9D1X0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nol3Q9D1X0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nol3Q9D1X0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms