Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chordc1Q9D1P4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chordc1Q9D1P4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.5 ms