Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SarnpQ9D1J3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SarnpQ9D1J3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SarnpQ9D1J3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms