Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lsm12Q9D0R8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms