Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snf8Q9CZ28 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Snf8Q9CZ28 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms