Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXB8

Alpk1, Alpha-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk1Q9CXB8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Alpk1Q9CXB8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Alpk1Q9CXB8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Alpk1Q9CXB8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms