Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atxn3Q9CVD2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atxn3Q9CVD2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Atxn3Q9CVD2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atxn3Q9CVD2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atxn3Q9CVD2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atxn3Q9CVD2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atxn3Q9CVD2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atxn3Q9CVD2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atxn3Q9CVD2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Atxn3Q9CVD2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atxn3Q9CVD2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atxn3Q9CVD2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atxn3Q9CVD2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atxn3Q9CVD2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atxn3Q9CVD2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atxn3Q9CVD2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atxn3Q9CVD2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atxn3Q9CVD2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atxn3Q9CVD2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atxn3Q9CVD2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atxn3Q9CVD2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atxn3Q9CVD2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atxn3Q9CVD2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Atxn3Q9CVD2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atxn3Q9CVD2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atxn3Q9CVD2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atxn3Q9CVD2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atxn3Q9CVD2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atxn3Q9CVD2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms