Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sppl3Q9CUS9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sppl3Q9CUS9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sppl3Q9CUS9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sppl3Q9CUS9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sppl3Q9CUS9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sppl3Q9CUS9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sppl3Q9CUS9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sppl3Q9CUS9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sppl3Q9CUS9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sppl3Q9CUS9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sppl3Q9CUS9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sppl3Q9CUS9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sppl3Q9CUS9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sppl3Q9CUS9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sppl3Q9CUS9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sppl3Q9CUS9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sppl3Q9CUS9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sppl3Q9CUS9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sppl3Q9CUS9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sppl3Q9CUS9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sppl3Q9CUS9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sppl3Q9CUS9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sppl3Q9CUS9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms