Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smc1aQ9CU62 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smc1aQ9CU62 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms