Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fcf1Q9CTH6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fcf1Q9CTH6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms