Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dis3Q9CSH3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dis3Q9CSH3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dis3Q9CSH3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dis3Q9CSH3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dis3Q9CSH3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dis3Q9CSH3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dis3Q9CSH3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dis3Q9CSH3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dis3Q9CSH3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Dis3Q9CSH3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dis3Q9CSH3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dis3Q9CSH3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dis3Q9CSH3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dis3Q9CSH3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dis3Q9CSH3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dis3Q9CSH3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dis3Q9CSH3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dis3Q9CSH3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dis3Q9CSH3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dis3Q9CSH3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dis3Q9CSH3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dis3Q9CSH3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dis3Q9CSH3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dis3Q9CSH3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dis3Q9CSH3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dis3Q9CSH3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dis3Q9CSH3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dis3Q9CSH3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dis3Q9CSH3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dis3Q9CSH3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dis3Q9CSH3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dis3Q9CSH3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dis3Q9CSH3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dis3Q9CSH3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dis3Q9CSH3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Dis3Q9CSH3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dis3Q9CSH3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dis3Q9CSH3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms