Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc96Q9CR92 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc96Q9CR92 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc96Q9CR92 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc96Q9CR92 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc96Q9CR92 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc96Q9CR92 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc96Q9CR92 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc96Q9CR92 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc96Q9CR92 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc96Q9CR92 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc96Q9CR92 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc96Q9CR92 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc96Q9CR92 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc96Q9CR92 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc96Q9CR92 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc96Q9CR92 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc96Q9CR92 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc96Q9CR92 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc96Q9CR92 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc96Q9CR92 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc96Q9CR92 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc96Q9CR92 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc96Q9CR92 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc96Q9CR92 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc96Q9CR92 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc96Q9CR92 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc96Q9CR92 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc96Q9CR92 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc96Q9CR92 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc96Q9CR92 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc96Q9CR92 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms