Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rwdd1Q9CQK7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rwdd1Q9CQK7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rwdd1Q9CQK7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rwdd1Q9CQK7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rwdd1Q9CQK7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rwdd1Q9CQK7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rwdd1Q9CQK7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rwdd1Q9CQK7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rwdd1Q9CQK7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rwdd1Q9CQK7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rwdd1Q9CQK7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rwdd1Q9CQK7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rwdd1Q9CQK7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rwdd1Q9CQK7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rwdd1Q9CQK7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rwdd1Q9CQK7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rwdd1Q9CQK7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rwdd1Q9CQK7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rwdd1Q9CQK7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rwdd1Q9CQK7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rwdd1Q9CQK7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rwdd1Q9CQK7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rwdd1Q9CQK7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rwdd1Q9CQK7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rwdd1Q9CQK7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rwdd1Q9CQK7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rwdd1Q9CQK7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Rwdd1Q9CQK7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rwdd1Q9CQK7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rwdd1Q9CQK7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Rwdd1Q9CQK7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rwdd1Q9CQK7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rwdd1Q9CQK7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rwdd1Q9CQK7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rwdd1Q9CQK7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rwdd1Q9CQK7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rwdd1Q9CQK7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rwdd1Q9CQK7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rwdd1Q9CQK7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rwdd1Q9CQK7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rwdd1Q9CQK7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rwdd1Q9CQK7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms