Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snrpb2Q9CQI7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snrpb2Q9CQI7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snrpb2Q9CQI7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms