Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufb5Q9CQH3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufb5Q9CQH3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms