Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nudt21Q9CQF3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nudt21Q9CQF3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nudt21Q9CQF3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nudt21Q9CQF3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nudt21Q9CQF3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nudt21Q9CQF3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nudt21Q9CQF3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nudt21Q9CQF3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nudt21Q9CQF3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nudt21Q9CQF3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nudt21Q9CQF3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nudt21Q9CQF3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nudt21Q9CQF3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nudt21Q9CQF3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.6 ms