Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Atp6v0e1Q9CQD8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atp6v0e1Q9CQD8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Atp6v0e1Q9CQD8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Atp6v0e1Q9CQD8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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