Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Sar1bQ9CQC9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sar1bQ9CQC9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sar1bQ9CQC9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms