Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Chmp3Q9CQ10 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chmp3Q9CQ10 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
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