Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNHG12Q9BXW3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.8 ms