Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWL3

C1orf43, Uncharacterized protein C1orf43, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43Q9BWL3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf43Q9BWL3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms