Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM2

DPCD, Protein DPCD, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPCDQ9BVM2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DPCDQ9BVM2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DPCDQ9BVM2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DPCDQ9BVM2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms