Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRNP25Q9BV90 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SNRNP25Q9BV90 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRNP25Q9BV90 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.3 ms