Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUV0

RSRP1, Arginine/serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1Q9BUV0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RSRP1Q9BUV0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RSRP1Q9BUV0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RSRP1Q9BUV0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RSRP1Q9BUV0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RSRP1Q9BUV0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSRP1Q9BUV0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSRP1Q9BUV0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSRP1Q9BUV0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSRP1Q9BUV0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSRP1Q9BUV0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSRP1Q9BUV0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSRP1Q9BUV0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSRP1Q9BUV0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms