Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIMM29Q9BSF4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIMM29Q9BSF4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TIMM29Q9BSF4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms