Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS31

ZNF649, Zinc finger protein 649, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF649Q9BS31 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF649Q9BS31 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF649Q9BS31 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms