Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TXNDC17Q9BRA2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms