Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf8Q99PV0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf8Q99PV0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms