Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smim3Q99PE5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim3Q99PE5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim3Q99PE5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms