Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bco2Q99NF1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bco2Q99NF1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bco2Q99NF1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bco2Q99NF1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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