Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Ms4a8Q99N10 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Ms4a8Q99N10 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Ms4a8Q99N10 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Ms4a8Q99N10 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Ms4a8Q99N10 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a8Q99N10 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Ms4a8Q99N10 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ms4a8Q99N10 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ms4a8Q99N10 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ms4a8Q99N10 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ms4a8Q99N10 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ms4a8Q99N10 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ms4a8Q99N10 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ms4a8Q99N10 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ms4a8Q99N10 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Ms4a8Q99N10 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ms4a8Q99N10 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ms4a8Q99N10 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Ms4a8Q99N10 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ms4a8Q99N10 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Ms4a8Q99N10 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ms4a8Q99N10 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ms4a8Q99N10 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ms4a8Q99N10 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Ms4a8Q99N10 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Ms4a8Q99N10 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ms4a8Q99N10 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Ms4a8Q99N10 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a8Q99N10 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a8Q99N10 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ms4a8Q99N10 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ms4a8Q99N10 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a8Q99N10 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a8Q99N10 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a8Q99N10 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a8Q99N10 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a8Q99N10 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a8Q99N10 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a8Q99N10 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a8Q99N10 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a8Q99N10 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a8Q99N10 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a8Q99N10 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a8Q99N10 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a8Q99N10 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a8Q99N10 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a8Q99N10 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a8Q99N10 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms