Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a4dQ99N05 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a4dQ99N05 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a4dQ99N05 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a4dQ99N05 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ms4a4dQ99N05 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Ms4a4dQ99N05 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ms4a4dQ99N05 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a4dQ99N05 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a4dQ99N05 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a4dQ99N05 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a4dQ99N05 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a4dQ99N05 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a4dQ99N05 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a4dQ99N05 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a4dQ99N05 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a4dQ99N05 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a4dQ99N05 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a4dQ99N05 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a4dQ99N05 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a4dQ99N05 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a4dQ99N05 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a4dQ99N05 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a4dQ99N05 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a4dQ99N05 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a4dQ99N05 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a4dQ99N05 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a4dQ99N05 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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