Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpgs1Q99MS8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpgs1Q99MS8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpgs1Q99MS8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpgs1Q99MS8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms