Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SrrtQ99MR6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SrrtQ99MR6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SrrtQ99MR6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SrrtQ99MR6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms