Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cmtm3Q99LJ5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cmtm3Q99LJ5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms